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溴芬蘭是常用的顏色顯示劑，同時也是一種重要的PH指示劑，在堿性條件下顯藍(lán)色，酸性條件下顯黃色。在等電聚焦過程中，溶液中的痕量溴芬蘭也被聚焦，形成藍(lán)色條帶并逐漸向酸性移動，同時顏色逐漸變黃。溴酚藍(lán)的移動大致發(fā)生在小分子的聚焦之后，蛋白質(zhì)大分子聚焦之前，可以通過溴芬蘭的顏色和移動的效果初步判斷等電聚焦效果的好壞。