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Nature級Co-IP實驗解讀:從操作流程到結(jié)果分析,助您輕松發(fā)文!

免疫共沉淀(Co-IP)技術(shù)簡介 Co-IP(免疫共沉淀)是生物醫(yī)學(xué)與基礎(chǔ)研究中常用的蛋白質(zhì)分析技術(shù),基于抗原 - 抗體免疫結(jié)合原理,可富集體內(nèi)目標蛋白及其互作復(fù)合體。 

根據(jù)目標蛋白是否帶標簽,Co-IP分為兩類: 1.  內(nèi)源性蛋白Co-IP:需使用IP級別抗體。 2.  標簽蛋白Co-IP:適用于目的蛋白缺乏優(yōu)質(zhì)IP抗體或細胞內(nèi)本底表達量低的場景,需構(gòu)建過表達質(zhì)粒并轉(zhuǎn)染至細胞。

coip實驗原理圖-輝駿生物coip高分文獻.png

圖1 Co-IP原理圖


Co-IP核心應(yīng)用 

1.  驗證已知蛋白-蛋白互作:免疫沉淀靶蛋白,確認其與已知結(jié)合蛋白的相互作用關(guān)系。 

2.  分析蛋白質(zhì)復(fù)合物:結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)鑒定復(fù)合物組分及翻譯后修飾(PTM),解析復(fù)合物構(gòu)成與PTM功能。 

3.  探究PTM對蛋白互作的調(diào)控:針對甲基化、磷酸化等修飾的靶蛋白,分析修飾狀態(tài)對互作的影響及調(diào)控機制。

4.  助力藥物靶點篩選與療效評估:篩選疾病通路中潛在藥物靶點;檢測候選藥物對蛋白復(fù)合物互作的影響,評估藥物療效。


Co-IP實驗操作流程 

1.  蛋白提取:裂解組織/細胞,獲取目標蛋白 

2.  Input制備:取裂解液制樣,驗證目標蛋白表達 

3.  免疫共沉淀:抗體磁珠捕獲目標蛋白,形成復(fù)合物 

4.  洗滌:磁力架輔助,漂洗液去除未結(jié)合蛋白 

5.  煮脫:熱處理分離磁珠-蛋白抗體復(fù)合物 

6.  蛋白檢測:通過WB或質(zhì)譜分析驗證結(jié)果 

PS:輝駿生物自有質(zhì)譜平臺,專業(yè)開展IP、pull-down產(chǎn)物微量蛋白鑒定及生信分析。


Co-IP解讀Nature案例1

免疫共沉淀結(jié)果表明,在人源高分化肝癌細胞系中觀察到了PRMT1與FBXO7之間的相互作用。這一新發(fā)現(xiàn)揭示了一種可能存在的全新細胞信號傳導(dǎo)途徑,為深入探究細胞內(nèi)互動關(guān)系提供了重要線索。

Co-IP解讀Nature案例-輝駿生物.png
圖2 引自FBXO7 ubiquitinates PRMT1 to suppress serine synthesis and tumor growth in hepatocellular carcinoma. Nat Commun 15(1):4790(2024). 


Co-IP解讀Nature案例2

在進行PRMT1基因敲除(KD)實驗時,使用了兩種不同的shRNA載體,觀察到FBXO7與PRMT1之間的相互作用明顯減弱。這提示PRMT1在調(diào)控FBXO7功能中扮演著重要角色,并進一步表明PRMT1可能參與了細胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的平衡。未來的研究可以深入探討PRMT1和FBXO7之間相互作用的分子機制,以揭示更多關(guān)于它們之間作用的細節(jié)。
Co-IP解讀Nature案例-輝駿生物coip實驗服務(wù).png
圖3 引自FBXO7 ubiquitinates PRMT1 to suppress serine synthesis and tumor growth in hepatocellular carcinoma. Nat Commun 15(1):4790(2024).


Co-IP解讀Nature案例3

通過在293T細胞中轉(zhuǎn)染Flag-AATF全長質(zhì)粒和不同截短體(檢測蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域),發(fā)現(xiàn)Flag-AATF全長與XRCC4存在相互作用,進一步驗證Flag-AATF的哪一部分與XRCC4發(fā)生互作,就構(gòu)建了截短體,發(fā)現(xiàn)缺失331-380氨基酸片段時,XRCC4條帶消失,表明Flag-AATF的331-380為XRCC4互作靶點。這一關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域的明確,不僅為解析 AATF 與 XRCC4 互作的分子基礎(chǔ)提供了核心依據(jù),更有助于深入探究二者協(xié)同參與的細胞生理或病理進程,為后續(xù)相關(guān)機制研究和靶向策略開發(fā)奠定了重要基礎(chǔ)。

Co-IP解讀Nature案例-輝駿生物coip實驗價格低.png
圖4 引自Elevated nonhomologous end-joining by AATF enables efficient DNA damage repair and therapeutic resistance in glioblastoma. Nat Commun 16(1):4941(2025).


IP 實驗的一大痛點,就是抗體磁珠孵育洗脫后,WB 結(jié)果常出現(xiàn)抗體輕重鏈雜帶,既掩蓋目的條帶、干擾結(jié)果解讀,甚至導(dǎo)致實驗失敗。

輝駿生物標簽納米抗體磁珠堪稱 “救星神器”:搭載羊駝源納米抗體,僅 15kD 單鏈結(jié)構(gòu),無傳統(tǒng)抗體輕重鏈,從根源杜絕雜帶污染,讓 WB 條帶干凈清晰。同時它親和力優(yōu)異、用量少、成本低,助力 IP 實驗高效完成。

輝駿生物標簽納米抗體磁珠-無輕重鏈污染.png

圖 5 納米抗體磁珠無抗體輕重鏈的 IP 結(jié)果示意圖

Flag、HA、V5、GFP 等多種標簽的納米抗體磁珠,以及配套 IP 試劑盒,輝駿生物均有供應(yīng),迎隨時聯(lián)系!


輝駿納米抗體磁珠產(chǎn)品信息


貨號

產(chǎn)品名稱

FI8201

ChainFree? Anti-Flag納米抗體磁珠

FI8202

ChainFree? Anti-HA納米抗體磁珠

FI8203

ChainFree? Anti-V5納米抗體磁珠

FI8204

ChainFree? Anti-Myc納米抗體磁珠

FI8205

ChainFree? Anti-GFP納米抗體磁珠

FI8206

ChainFree? Anti-RFP納米抗體磁珠

PS:輝駿生物標簽納米抗體磁珠結(jié)合量高,親和力強,無輕重鏈污染。


輝駿生物Co-IP客戶文章

客戶結(jié)果呈現(xiàn):WB結(jié)果表明,使用輝駿生物的磁珠在樣品中獲得了單一清晰的靶蛋白條帶,且富集效率高,具備卓越的特異性 (Flag-GPX4與HA-OTUB1免疫共沉淀結(jié)果)

輝駿生物Co-IP客戶文章.png
圖6 Flag-GPX4與HA-OTUB1免疫共沉淀結(jié)果圖


如果您在使用納米抗體磁珠上還有疑問,歡迎咨詢輝駿生物:4006991663。我們還提供各種類型蛋白互作試劑盒以及互作實驗服務(wù)RIP、RNA pull downChIP、DNA pull down、IP實驗),可根據(jù)實驗需求定進行選擇,助力您的科研更高效、更精準!


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