單細胞染色質(zhì)修飾分析

染色質(zhì)的修飾對于調(diào)節(jié)幾乎所有以 DNA 為模板的生物過程至關(guān)重要。單細胞染色質(zhì)修飾譜可用于評估染色質(zhì)修飾，這可以提供表觀遺傳變化和生理變化之間的關(guān)系。

核的結(jié)構(gòu)。細胞部分：核膜、核質(zhì)、核基質(zhì)、染色質(zhì)和核仁。圖片來源：Designua / Shutterstock

染色質(zhì)修飾

染色質(zhì)修飾是通過共價組蛋白修飾和核小體修飾實現(xiàn)的。組蛋白乙?；?、去乙?；⒓谆土姿峄枪矁r組蛋白修飾的形式，由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (HAT)、組蛋白去乙?；?(HDAC)、組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶 (HNMT) 和激酶等酶進行。由 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶 (DNMT) 進行的 DNA 甲基化和由激酶進行的 DNA 磷酸化是核小體修飾的形式。染色質(zhì)重塑對于調(diào)節(jié)基因表達和其他調(diào)節(jié)過程很重要，例如卵細胞 DNA 復(fù)制和修復(fù)、細胞凋亡和染色體分離。

染色質(zhì)修飾分析的類型

染色體免疫沉淀測序

染色體免疫沉淀測序 (ChIP-seq) 可以分析蛋白質(zhì)與 DNA 的相互作用，并提供有關(guān)表觀遺傳變化的信息。 ChIP-seq實驗服務(wù)涉及將蛋白質(zhì)與 DNA 交聯(lián)，然后通過超聲處理進行 DNA 片段化。然后添加珠連接抗體以免疫沉淀靶蛋白。

染色質(zhì)免疫沉淀定量PCR分析

染色質(zhì)免疫沉淀定量 PCR 分析 (ChIP-qPCR) 可用于評估已知基因組結(jié)合位點的蛋白質(zhì)-DNA 相互作用。當位點未知時，可以針對潛在的調(diào)控區(qū)域（例如啟動子）設(shè)計 qPCR 引物。 ChIP-qPCR 具有與標準 ChIP-qPCR 非常相似的程序，但在 ChIP-qPCR 實驗結(jié)束時，得到的 DNA 會進行 qPCR，然后進行分析。

輝駿生物提供的ChIP染色質(zhì)免疫共沉淀服務(wù)分為以下兩種：

1. ChIP qPCR實驗，用于檢測某樣本中的誘餌蛋白和待測DNA片段是否結(jié)合；

2. ChIP seq實驗，用于篩選某樣本中的誘餌蛋白可以結(jié)合哪些DNA區(qū)域。

ChIP（染色質(zhì)免疫共沉淀）檢測服務(wù)
服務(wù)項目	服務(wù)內(nèi)容	結(jié)果交付	實驗周期	客戶提供	價格
ChIP qPCR	Western blot檢測樣本（input）中的誘餌蛋白	Western blot檢測圖	5-6周	實驗樣本誘餌蛋白的IP級抗體實驗信息表（樣本信息，誘餌蛋白及待測DNA序列）	點擊詢價
	ChIP調(diào)取誘餌蛋白及其結(jié)合的DNA片段（2組：實驗組和對照組）	ChIP實驗報告
	Western blot檢測ChIP產(chǎn)物中的誘餌蛋白	Western blot檢測圖
	qPCR檢測ChIP產(chǎn)物中的待測DNA片段	qPCR檢測數(shù)據(jù)
ChIP seq	Western blot檢測樣本（input）中的誘餌蛋白	Western blot檢測圖	5-6周	實驗樣本誘餌蛋白的IP級抗體實驗信息表（樣本信息，誘餌蛋白序列）	點擊詢價
	ChIP調(diào)取誘餌蛋白及其結(jié)合的DNA片段（2組：實驗組和對照組）	ChIP實驗報告
	Western blot檢測ChIP產(chǎn)物中的誘餌蛋白	Western blot檢測圖
	seq檢測ChIP產(chǎn)物中的DNA片段并分析	seq檢測結(jié)果、檢測和分析報告	9周

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ChIP服務(wù)優(yōu)勢*輝駿生物

近十年服務(wù)經(jīng)驗，服務(wù)案例眾多，客戶發(fā)文Nature Cell Biology等高質(zhì)量期刊

可對圍繞DNA結(jié)合蛋白開展的整體課題提供全方位方案建議

自有分子及細胞生物實驗平臺，能有效制定并執(zhí)行最優(yōu)的實驗路線

售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章，確?？蛻舭残倪M行下游實驗及投稿

質(zhì)譜

質(zhì)譜流式細胞儀結(jié)合了流式細胞儀和質(zhì)譜儀，用于辨別細胞的特性。抗體與純元素結(jié)合，用于標記細胞蛋白。然后將細胞霧化并通過氬等離子體將抗體電離。產(chǎn)生的金屬信號由質(zhì)譜儀分析。該方法用于分析染色質(zhì)修飾。

LC-MS/MS蛋白質(zhì)譜鑒定應(yīng)用范圍

★IP，Co-IP，Pull-down類蛋白相互作用樣本（膠條或溶液）的鑒定；

★細胞器，外泌體等簡單樣本中的所有表達蛋白質(zhì)的鑒定（全譜分析）。

LC-MS/MS質(zhì)譜鑒定服務(wù)信息-輝駿生物

項目名稱

客戶提供

結(jié)果交付

實驗周期

價格

LC-MS/MS蛋白鑒定

蛋白溶液（干冰運輸）

蛋白膠條/膠點（冰袋運輸）

廣州地區(qū)可上門取樣

樣本信息表

蛋白及肽段鑒定結(jié)果表

質(zhì)譜檢索網(wǎng)頁

指定肽段的質(zhì)譜圖

質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)

實驗報告

2周

點擊詢價

使用染色質(zhì)修飾 Pprofiling 進行的發(fā)現(xiàn)

老化

最近，隨著年齡的增長，觀察到表觀遺傳變異的數(shù)量增加。多重質(zhì)譜流式分析用于在單細胞水平上分析原代人類免疫細胞中染色質(zhì)修飾的水平。對年輕人和老年人進行了差異分析，結(jié)果表明，衰老表明個體之間的異質(zhì)性增加，染色質(zhì)修飾的細胞間變異性增加。這些發(fā)現(xiàn)顯示了年齡對染色質(zhì)修飾的影響。

乳腺癌

在乳腺癌模型的惡性轉(zhuǎn)化過程中發(fā)現(xiàn)了表觀遺傳變化。通過在乳腺上皮細胞中表達三種癌基因來制作乳腺癌模型。進行了 ChIP 分析，然后進行了組蛋白甲基化的下一代測序。使用蛋白質(zhì)印跡、定量逆轉(zhuǎn)錄酶 PCR (qRT-PCR) 和免疫染色來確定基因表達。該研究發(fā)現(xiàn)，在乳腺癌模型中，參與抑制某些癌基因的兩個組蛋白標記減少了。

免疫抑制

SUMOylation 是一種轉(zhuǎn)錄后修飾，涉及各種細胞過程，例如轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、細胞凋亡、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和細胞周期進程。人類有 3 種 SUMO 蛋白（SUMO-1 和 SUMO-2/3）。一項研究發(fā)現(xiàn)，皰疹病毒（卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒 (KSHV)）已經(jīng)進化出直接和間接調(diào)節(jié) SUMO 機制以避免宿主免疫系統(tǒng)的機制。進行的 ChIP-seq 實驗發(fā)現(xiàn) KSHV 重新激活后 SUMO-2/3 顯著增加。基因本體分析發(fā)現(xiàn)了參與細胞免疫反應(yīng)和細胞因子信號傳導(dǎo)的基因。 KSHV 通過增加 SUMO-2/3 的轉(zhuǎn)錄以阻礙免疫反應(yīng)來避免免疫系統(tǒng)。