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納米抗體磁珠介紹+CoIP實驗應(yīng)用全解析

 01 納米抗體磁珠簡介 

Q1 納米抗體是什么?

納米抗體(Nanobody,Nb)是一類源自駱駝科動物(如駱駝、羊駝)的單域抗體片段,核心特征是僅由重鏈可變區(qū)(VHH)構(gòu)成,無輕鏈結(jié)構(gòu)。關(guān)鍵特點包括:

(1)分子量極?。簝H15 kDa,約為傳統(tǒng)抗體的1/10;

(2)特異性強:抗原結(jié)合位點與傳統(tǒng)抗體相當(dāng),能精準(zhǔn)識別目標(biāo)分子(如蛋白、抗原表位);

(3)穩(wěn)定性高:耐酸堿、耐高溫、抗蛋白酶降解,在復(fù)雜環(huán)境(如生物樣本、工業(yè)反應(yīng)體系)中仍能保持活性;

(4)易生產(chǎn)與改造:可通過基因工程在細(xì)胞中大量表達(dá)。


IgG抗體與納米抗體結(jié)構(gòu)示意圖-輝駿生物.jpg圖片
圖1 IgG抗體與納米抗體結(jié)構(gòu)示意圖

Q2 納米抗體磁珠是什么?

磁珠是一種具有超順磁性的微小球體,由磁性內(nèi)核(通常為鐵的衍生物)、生物相容性外殼以及表面偶聯(lián)的各種功能配體組成。這種獨特結(jié)構(gòu)使磁珠在外加磁場作用下表現(xiàn)出弱磁性,便于快速吸附分離,而撤去磁場后自身就不再帶有磁性,可輕松重懸分散。

將納米抗體(分子量小、特異性強)偶聯(lián)到磁性微球表面形成的復(fù)合物,主要用于靶向捕獲、分離生物樣本中的特定分子(如蛋白、抗原)。


納米抗體磁珠結(jié)構(gòu)示意圖-輝駿生物.jpg
圖2 納米抗體磁珠結(jié)構(gòu)示意圖


Q3 納米抗體磁珠主要用在哪些實驗?

(1)免疫沉淀 (IP):免疫共沉淀(CoIP)RNA結(jié)合蛋白免疫共沉淀(RIP)、染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP),捕獲樣本中與目標(biāo)蛋白相互作用的蛋白或核酸復(fù)合物,研究大分子間的相互作用;
(2)蛋白純化:從復(fù)雜樣本中特異性捕獲目標(biāo)蛋白(如酶、抗原、重組蛋白);
(3)外泌體分離:靶向結(jié)合外泌體表面標(biāo)志物 (CD63、CD81等),從復(fù)雜樣本中捕獲外泌體;
(4)細(xì)胞分離:靶向結(jié)合某些細(xì)胞表面的特異性標(biāo)志物 (如CD分子、腫瘤抗原),分離標(biāo)記的細(xì)胞。


 02 納米抗體磁珠在IP實驗中的優(yōu)勢 


Q1 納米抗體磁珠和傳統(tǒng)抗體磁珠相比,優(yōu)勢是什么?

(1)納米抗體分子量小、且常用種屬(小鼠、兔、大鼠、羊等)的二抗無法識別,因此納米抗體磁珠可以完全避免IP時的抗體輕重鏈污染問題;


納米抗體磁珠與IgG抗體磁珠結(jié)構(gòu)示意圖-輝駿生物.jpg
圖3 納米抗體磁珠與IgG抗體磁珠結(jié)構(gòu)示意圖

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圖4 納米抗體磁珠富集后無抗體輕重鏈污染示意圖


(2)納米抗體與磁珠的結(jié)合效率更高,親和力和特異性更強;

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圖5 納米抗體磁珠富集后進(jìn)行IP親和力檢測示意圖


(3)穩(wěn)定性好(耐酸堿/高溫),分別在4℃和40℃的情況下保存7天后進(jìn)行檢測,IP效果不會受明顯的影響。

輝駿生物納米抗體磁珠在4℃和40℃條件下保存7天后進(jìn)行IP穩(wěn)定性檢測示意圖.jpg
圖6 納米抗體磁珠在4℃和40℃條件下保存7天后進(jìn)行IP穩(wěn)定性檢測示意圖

Q2 非特異性吸附多嗎?如何減少? 

相比傳統(tǒng)抗體磁珠更少,但仍可能存在。減少方法:①優(yōu)化洗滌液的離子強度(如調(diào)整NaCl濃度);②控制孵育時間和溫度(避免過度結(jié)合);③減少蛋白的量或降低蛋白濃度。


  03 IP實驗的常見問題及解決辦法  


Q1 使用納米抗體磁珠如何實現(xiàn)“分離”?需要特殊儀器嗎?

無需復(fù)雜儀器,只需搭配磁性分離架(或磁力攪拌器)——將反應(yīng)后的磁珠溶液置于磁場中,磁珠會被吸附到管壁,倒掉上清即可完成“捕獲-分離”,操作簡單。


Q2 離心操作會損壞納米抗體磁珠嗎?離心轉(zhuǎn)速該怎么設(shè)?

低速離心不會損壞,但高速可能導(dǎo)致磁珠聚團。建議轉(zhuǎn)速≤800 g,離心時間1-2 min,僅在需要快速收集磁珠時使用(優(yōu)先推薦用磁性分離架,避免離心對磁珠的潛在影響)。


Q3 樣本中含有EDTA,會影響納米抗體磁珠的使用嗎?

低濃度EDTA(如≤5 mM)通常無影響,若濃度過高(如>10 mM),可能會影響磁珠穩(wěn)定性或納米抗體與抗原的結(jié)合效率,建議提前用透析或稀釋方式降低EDTA濃度。


Q4 實驗中發(fā)現(xiàn)磁珠出現(xiàn)聚團,是什么原因?該怎么處理?

常見原因包括冷凍、干燥、結(jié)合蛋白過量或緩沖液離子強度異常。  處理方法:①若未完全聚團,可加入少量緩沖液,輕輕吹打至分散;②減少蛋白加入量或進(jìn)行適量稀釋;③若聚團嚴(yán)重,建議更換新的磁珠,避免影響結(jié)合效率。


Q5 延長磁珠與樣本的孵育時間,會提高結(jié)合效率嗎?

延長時間可能會提高結(jié)合效率,但是也有可能增加非特異性吸附。  若樣本中目標(biāo)蛋白豐度極低,可延長到4 h至過夜,但需同時增加洗滌次數(shù),減少雜蛋白吸附;延長至4小時以上時,需預(yù)實驗驗證結(jié)合效率與非特異性吸附的平衡。


  04 磁珠儲存  

Q1 納米抗體磁珠的儲存條件?

(1)4℃冷藏儲存,避免冷凍,避免磁珠聚團;  (2)確保保存液沒過磁珠,避免磁珠上的抗體暴露在空氣中而失活;每次取用后盡快密封放回冰箱,避免長期室溫放置或保存液揮發(fā)。



Q2 納米抗體磁珠室溫放置幾小時或收貨時冰袋融化,能否繼續(xù)使用?


輝駿生物生產(chǎn)的納米抗體磁珠在出廠前均做過穩(wěn)定性測試,37℃烘箱中放置7天,不影響磁珠效果,所以物流或短期室溫放置不影響使用,常規(guī)保存需放置4℃冰箱,但應(yīng)避免冷凍。



Q3 偶聯(lián)的納米抗體會不會脫落?如何驗證偶聯(lián)穩(wěn)定性?


低濃度EDTA(如≤5 mM)通常無影響,若濃度過高(如>10 mM),可能會影響磁珠穩(wěn)定性或納米抗體與抗原的結(jié)合效率,建議提前用透析或稀釋方式降低EDTA濃度。


Q4 實驗中發(fā)現(xiàn)磁珠出現(xiàn)聚團,是什么原因?該怎么處理?

正常儲存和使用下,脫落率極低(因為其為共價鍵偶聯(lián)結(jié)合)。驗證方法:①取少量磁珠溶液離心,檢測上清中是否有游離抗體(如用ELISA、SDS-PAGE);②多次洗滌后,測試磁珠的結(jié)合效率是否下降。


  05 納米抗體偶聯(lián)磁珠  


貨號

產(chǎn)品名稱

FI8201

ChainFree? Anti-Flag納米抗體磁珠

FI8202

ChainFree? Anti-HA納米抗體磁珠

FI8203

ChainFree? Anti-V5納米抗體磁珠

FI8204

ChainFree? Anti-Myc納米抗體磁珠

FI8205

ChainFree? Anti-GFP納米抗體磁珠

FI8206

ChainFree? Anti-RFP納米抗體磁珠


輝駿生物納米抗體磁珠與普通抗體磁珠富集后IP結(jié)果示意圖.jpg
圖7 納米抗體磁珠與普通抗體磁珠富集后IP結(jié)果示意圖
如果您在使用納米抗體磁珠上還有疑問,歡迎咨詢我們的技術(shù)人員。輝駿生物還提供各種類型蛋白互作試劑盒以及互作實驗服務(wù)RIP、RNA pull downChIP、DNA pull down、IP實驗),可根據(jù)實驗需求定進(jìn)行選擇,助力您的科研更高效、更精準(zhǔn)!

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